Commit f709ca0e authored by gonciarz's avatar gonciarz

Merge branch 'developJava6' into masterJava6

parents 80694d54 5fca8b28
File;Image ID;Objects ch1;Mean size in ch1;Mean surface in ch1;Mean length in ch1
%Parameters: background removal false window size 10 stddev PSF xy 1.5 stddev PSF z 3.44 Regularization 0.2 0.2 Min intensity ch1 0.1 Min intensity ch2 0.1 subpixel false Cell mask ch1 false mask threshold ch1 0.0015 Cell mask ch2 false mask threshold ch2 0.0015 Intensity estimation Automatic Noise model Poisson;
tmp_1.tif;0;3;25.3333;48.0;1.3333
Image_ID;Object_ID;Size;Perimeter;Length;Intensity;Coord_X;Coord_Y;Coord_Z
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602330370/tmp_1.tif
0;0;21.0;41.0;2.0;2130.03187090407;14.523809432983398;10.904762268066406;1.1904761791229248
0;0;35.0;55.0;0.0;1019.5706596908651;0.6000000238418579;12.571428298950195;10.742856979370117
0;0;20.0;48.0;2.0;5658.4965660007965;9.800000190734863;17.799999237060547;14.800000190734863
File;Image ID;Objects ch1;Mean size in ch1;Mean surface in ch1;Mean length in ch1
%Parameters:background removal false window size 10 stddev PSF xy 1.5 stddev PSF z 3.44 Regularization 0.2 0.2 Min intensity ch1 0.1 Min intensity ch2 0.1 subpixel false Cell mask ch1 false mask threshold ch1 0.0015 Cell mask ch2 false mask threshold ch2 0.0015 Intensity estimation Automatic Noise model Poisson;
tmp_1.tif;0;3;25.3333;48.0;1.3333
Image_ID;Object_ID;Size;Perimeter;Length;Intensity;Coord_X;Coord_Y;Coord_Z
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602330370/tmp_1.tif
0;0;21.0;41.0;2.0;2130.03187090407;14.523809432983398;10.904762268066406;1.1904761791229248
0;0;35.0;55.0;0.0;1019.5706596908651;0.6000000238418579;12.571428298950195;10.742856979370117
0;0;20.0;48.0;2.0;5658.4965660007965;9.800000190734863;17.799999237060547;14.800000190734863
File;Image ID;Objects ch1;Mean size in ch1;Mean surface in ch1;Mean length in ch1
%Parameters: background removal false window size 10 stddev PSF xy 1.5 stddev PSF z 3.44 Regularization 0.2 0.2 Min intensity ch1 0.1 Min intensity ch2 0.1 subpixel false Cell mask ch1 false mask threshold ch1 0.0015 Cell mask ch2 false mask threshold ch2 0.0015 Intensity estimation Automatic Noise model Poisson;
tmp_1.tif;0;4;5.25;16.0;1.75
Image_ID;Object_ID;Size;Perimeter;Length;Intensity;Coord_X;Coord_Y;Coord_Z
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602335480/tmp_1.tif
0;0;7.0;26.0;2.0;4195.096491167105;16.285715103149414;7.285714149475098;3.7142856121063232
0;0;7.0;13.0;3.0;880.390650849034;0.2857142984867096;13.0;9.142857551574707
0;0;3.0;7.0;1.0;522.4448319627804;6.333333492279053;0.3333333432674408;14.0
0;0;4.0;18.0;1.0;17512.42638264492;11.25;15.25;14.25
File;Image ID;Objects ch1;Mean size in ch1;Mean surface in ch1;Mean length in ch1
%Parameters:background removal false window size 10 stddev PSF xy 1.5 stddev PSF z 3.44 Regularization 0.2 0.2 Min intensity ch1 0.1 Min intensity ch2 0.1 subpixel false Cell mask ch1 false mask threshold ch1 0.0015 Cell mask ch2 false mask threshold ch2 0.0015 Intensity estimation Automatic Noise model Poisson;
tmp_1.tif;0;4;5.25;16.0;1.75
Image_ID;Object_ID;Size;Perimeter;Length;Intensity;Coord_X;Coord_Y;Coord_Z
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602335480/tmp_1.tif
0;0;7.0;26.0;2.0;4195.096491167105;16.285715103149414;7.285714149475098;3.7142856121063232
0;0;7.0;13.0;3.0;880.390650849034;0.2857142984867096;13.0;9.142857551574707
0;0;3.0;7.0;1.0;522.4448319627804;6.333333492279053;0.3333333432674408;14.0
0;0;4.0;18.0;1.0;17512.42638264492;11.25;15.25;14.25
File;Image ID;Objects ch1;Mean size in ch1;Mean surface in ch1;Mean length in ch1
%Parameters: background removal false window size 10 stddev PSF xy 1.5 stddev PSF z 3.44 Regularization 0.2 0.2 Min intensity ch1 0.1 Min intensity ch2 0.1 subpixel false Cell mask ch1 false mask threshold ch1 0.0015 Cell mask ch2 false mask threshold ch2 0.0015 Intensity estimation Automatic Noise model Poisson;
tmp_1.tif;0;2;27.0;54.5;2.0
Image_ID;Object_ID;Size;Perimeter;Length;Intensity;Coord_X;Coord_Y;Coord_Z
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602339577/tmp_1.tif
0;0;29.0;66.0;2.0;1800.1588839831986;17.79310417175293;7.896551609039307;5.482758522033691
0;0;25.0;43.0;2.0;1317.6769026725592;0.5600000023841858;6.800000190734863;11.720000267028809
File;Image ID;Objects ch1;Mean size in ch1;Mean surface in ch1;Mean length in ch1
%Parameters:background removal false window size 10 stddev PSF xy 1.5 stddev PSF z 3.44 Regularization 0.2 0.2 Min intensity ch1 0.1 Min intensity ch2 0.1 subpixel false Cell mask ch1 false mask threshold ch1 0.0015 Cell mask ch2 false mask threshold ch2 0.0015 Intensity estimation Automatic Noise model Poisson;
tmp_1.tif;0;2;27.0;54.5;2.0
Image_ID;Object_ID;Size;Perimeter;Length;Intensity;Coord_X;Coord_Y;Coord_Z
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602339577/tmp_1.tif
0;0;29.0;66.0;2.0;1800.1588839831986;17.79310417175293;7.896551609039307;5.482758522033691
0;0;25.0;43.0;2.0;1317.6769026725592;0.5600000023841858;6.800000190734863;11.720000267028809
File;Image ID;Objects ch1;Mean size in ch1;Mean surface in ch1;Mean length in ch1
%Parameters: background removal false window size 10 stddev PSF xy 1.5 stddev PSF z 3.44 Regularization 0.2 0.2 Min intensity ch1 0.1 Min intensity ch2 0.1 subpixel false Cell mask ch1 false mask threshold ch1 0.0015 Cell mask ch2 false mask threshold ch2 0.0015 Intensity estimation Automatic Noise model Poisson;
tmp_1.tif;0;2;44.5;90.0;2.0
Image_ID;Object_ID;Size;Perimeter;Length;Intensity;Coord_X;Coord_Y;Coord_Z
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602344538/tmp_1.tif
0;0;64.0;122.0;2.0;1250.1709444022522;17.890625;10.9375;5.125
0;0;25.0;58.0;2.0;4065.83182541896;7.800000190734863;14.720000267028809;13.4399995803833
File;Image ID;Objects ch1;Mean size in ch1;Mean surface in ch1;Mean length in ch1
%Parameters:background removal false window size 10 stddev PSF xy 1.5 stddev PSF z 3.44 Regularization 0.2 0.2 Min intensity ch1 0.1 Min intensity ch2 0.1 subpixel false Cell mask ch1 false mask threshold ch1 0.0015 Cell mask ch2 false mask threshold ch2 0.0015 Intensity estimation Automatic Noise model Poisson;
tmp_1.tif;0;2;44.5;90.0;2.0
Image_ID;Object_ID;Size;Perimeter;Length;Intensity;Coord_X;Coord_Y;Coord_Z
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602344538/tmp_1.tif
0;0;64.0;122.0;2.0;1250.1709444022522;17.890625;10.9375;5.125
0;0;25.0;58.0;2.0;4065.83182541896;7.800000190734863;14.720000267028809;13.4399995803833
File;Image ID;Objects ch1;Mean size in ch1;Mean surface in ch1;Mean length in ch1
%Parameters: background removal false window size 10 stddev PSF xy 1.5 stddev PSF z 3.44 Regularization 0.2 0.2 Min intensity ch1 0.1 Min intensity ch2 0.1 subpixel false Cell mask ch1 false mask threshold ch1 0.0015 Cell mask ch2 false mask threshold ch2 0.0015 Intensity estimation Automatic Noise model Poisson;
tmp_1.tif;0;2;16.5;48.0;1.5
Image_ID;Object_ID;Size;Perimeter;Length;Intensity;Coord_X;Coord_Y;Coord_Z
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602349301/tmp_1.tif
0;0;9.0;32.0;1.0;3744.629256154277;17.22222137451172;14.88888931274414;6.0
0;0;24.0;64.0;2.0;4109.821107706579;10.625;14.083333015441895;13.791666984558105
File;Image ID;Objects ch1;Mean size in ch1;Mean surface in ch1;Mean length in ch1
%Parameters:background removal false window size 10 stddev PSF xy 1.5 stddev PSF z 3.44 Regularization 0.2 0.2 Min intensity ch1 0.1 Min intensity ch2 0.1 subpixel false Cell mask ch1 false mask threshold ch1 0.0015 Cell mask ch2 false mask threshold ch2 0.0015 Intensity estimation Automatic Noise model Poisson;
tmp_1.tif;0;2;16.5;48.0;1.5
Image_ID;Object_ID;Size;Perimeter;Length;Intensity;Coord_X;Coord_Y;Coord_Z
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602349301/tmp_1.tif
0;0;9.0;32.0;1.0;3744.629256154277;17.22222137451172;14.88888931274414;6.0
0;0;24.0;64.0;2.0;4109.821107706579;10.625;14.083333015441895;13.791666984558105
File;Image ID;Objects ch1;Mean size in ch1;Mean surface in ch1;Mean length in ch1
%Parameters: background removal false window size 10 stddev PSF xy 1.5 stddev PSF z 3.44 Regularization 0.2 0.2 Min intensity ch1 0.1 Min intensity ch2 0.1 subpixel false Cell mask ch1 false mask threshold ch1 0.0015 Cell mask ch2 false mask threshold ch2 0.0015 Intensity estimation Automatic Noise model Poisson;
tmp_1.tif;0;2;21.5;61.0;3.0
Image_ID;Object_ID;Size;Perimeter;Length;Intensity;Coord_X;Coord_Y;Coord_Z
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602353909/tmp_1.tif
0;0;26.0;70.0;3.0;1787.5943960874624;19.19230842590332;14.615385055541992;3.423076868057251
0;0;17.0;52.0;3.0;5401.7056180885;11.176470756530762;15.823529243469238;14.0
File;Image ID;Objects ch1;Mean size in ch1;Mean surface in ch1;Mean length in ch1
%Parameters:background removal false window size 10 stddev PSF xy 1.5 stddev PSF z 3.44 Regularization 0.2 0.2 Min intensity ch1 0.1 Min intensity ch2 0.1 subpixel false Cell mask ch1 false mask threshold ch1 0.0015 Cell mask ch2 false mask threshold ch2 0.0015 Intensity estimation Automatic Noise model Poisson;
tmp_1.tif;0;2;21.5;61.0;3.0
Image_ID;Object_ID;Size;Perimeter;Length;Intensity;Coord_X;Coord_Y;Coord_Z
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602353909/tmp_1.tif
0;0;26.0;70.0;3.0;1787.5943960874624;19.19230842590332;14.615385055541992;3.423076868057251
0;0;17.0;52.0;3.0;5401.7056180885;11.176470756530762;15.823529243469238;14.0
FileName;Frame;Channel;NumOfObjects;MeanSize;MeanSurface;MeanLength
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602330370/tmp_1.tif
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886218064/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;3;25.3333;48.0;1.3333
FileName;Frame;Channel;Id;X;Y;Z;Size;Perimeter;Length;Intensity
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602330370/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;1;14.523809432983398;10.904762268066406;1.1904761791229248;21.0;41.0;2.0;2130.03187090407
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886218064/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;1;14.523809432983398;10.904762268066406;1.1904761791229248;21.0;41.0;2.0;2130.0318709040685
tmp_1.tif;0;0;2;0.6000000238418579;12.571428298950195;10.742856979370117;35.0;55.0;0.0;1019.5706596908651
tmp_1.tif;0;0;3;9.800000190734863;17.799999237060547;14.800000190734863;20.0;48.0;2.0;5658.4965660007965
FileName;Frame;Channel;NumOfObjects;MeanSize;MeanSurface;MeanLength
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602330370/tmp_1.tif
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886218064/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;3;25.3333;48.0;1.3333
FileName;Frame;Channel;Id;X;Y;Z;Size;Perimeter;Length;Intensity
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602330370/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;1;14.523809432983398;10.904762268066406;1.1904761791229248;21.0;41.0;2.0;2130.03187090407
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886218064/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;1;14.523809432983398;10.904762268066406;1.1904761791229248;21.0;41.0;2.0;2130.0318709040685
tmp_1.tif;0;0;2;0.6000000238418579;12.571428298950195;10.742856979370117;35.0;55.0;0.0;1019.5706596908651
tmp_1.tif;0;0;3;9.800000190734863;17.799999237060547;14.800000190734863;20.0;48.0;2.0;5658.4965660007965
FileName;Frame;Channel;NumOfObjects;MeanSize;MeanSurface;MeanLength
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602335480/tmp_1.tif
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886219843/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;4;5.25;16.0;1.75
FileName;Frame;Channel;Id;X;Y;Z;Size;Perimeter;Length;Intensity
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602335480/tmp_1.tif
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886219843/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;1;16.285715103149414;7.285714149475098;3.7142856121063232;7.0;26.0;2.0;4195.096491167105
tmp_1.tif;0;0;2;0.2857142984867096;13.0;9.142857551574707;7.0;13.0;3.0;880.390650849034
tmp_1.tif;0;0;3;6.333333492279053;0.3333333432674408;14.0;3.0;7.0;1.0;522.4448319627804
......
FileName;Frame;Channel;NumOfObjects;MeanSize;MeanSurface;MeanLength
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602335480/tmp_1.tif
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886219843/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;4;5.25;16.0;1.75
FileName;Frame;Channel;Id;X;Y;Z;Size;Perimeter;Length;Intensity
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602335480/tmp_1.tif
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886219843/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;1;16.285715103149414;7.285714149475098;3.7142856121063232;7.0;26.0;2.0;4195.096491167105
tmp_1.tif;0;0;2;0.2857142984867096;13.0;9.142857551574707;7.0;13.0;3.0;880.390650849034
tmp_1.tif;0;0;3;6.333333492279053;0.3333333432674408;14.0;3.0;7.0;1.0;522.4448319627804
......
FileName;Frame;Channel;NumOfObjects;MeanSize;MeanSurface;MeanLength
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602339577/tmp_1.tif
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886222916/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;2;27.0;54.5;2.0
FileName;Frame;Channel;Id;X;Y;Z;Size;Perimeter;Length;Intensity
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602339577/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;1;17.79310417175293;7.896551609039307;5.482758522033691;29.0;66.0;2.0;1800.1588839831986
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886222916/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;1;17.79310417175293;7.896551609039307;5.482758522033691;29.0;66.0;2.0;1800.1588839832
tmp_1.tif;0;0;2;0.5600000023841858;6.800000190734863;11.720000267028809;25.0;43.0;2.0;1317.6769026725592
FileName;Frame;Channel;NumOfObjects;MeanSize;MeanSurface;MeanLength
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602339577/tmp_1.tif
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886222916/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;2;27.0;54.5;2.0
FileName;Frame;Channel;Id;X;Y;Z;Size;Perimeter;Length;Intensity
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602339577/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;1;17.79310417175293;7.896551609039307;5.482758522033691;29.0;66.0;2.0;1800.1588839831986
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886222916/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;1;17.79310417175293;7.896551609039307;5.482758522033691;29.0;66.0;2.0;1800.1588839832
tmp_1.tif;0;0;2;0.5600000023841858;6.800000190734863;11.720000267028809;25.0;43.0;2.0;1317.6769026725592
FileName;Frame;Channel;NumOfObjects;MeanSize;MeanSurface;MeanLength
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602344538/tmp_1.tif
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886225987/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;2;44.5;90.0;2.0
FileName;Frame;Channel;Id;X;Y;Z;Size;Perimeter;Length;Intensity
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602344538/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;1;17.890625;10.9375;5.125;64.0;122.0;2.0;1250.1709444022522
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886225987/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;1;17.890625;10.9375;5.125;64.0;122.0;2.0;1250.170944402252
tmp_1.tif;0;0;2;7.800000190734863;14.720000267028809;13.4399995803833;25.0;58.0;2.0;4065.83182541896
FileName;Frame;Channel;NumOfObjects;MeanSize;MeanSurface;MeanLength
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602344538/tmp_1.tif
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886225987/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;2;44.5;90.0;2.0
FileName;Frame;Channel;Id;X;Y;Z;Size;Perimeter;Length;Intensity
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602344538/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;1;17.890625;10.9375;5.125;64.0;122.0;2.0;1250.1709444022522
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886225987/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;1;17.890625;10.9375;5.125;64.0;122.0;2.0;1250.170944402252
tmp_1.tif;0;0;2;7.800000190734863;14.720000267028809;13.4399995803833;25.0;58.0;2.0;4065.83182541896
FileName;Frame;Channel;NumOfObjects;MeanSize;MeanSurface;MeanLength
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602349301/tmp_1.tif
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886229056/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;2;16.5;48.0;1.5
FileName;Frame;Channel;Id;X;Y;Z;Size;Perimeter;Length;Intensity
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602349301/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;1;17.22222137451172;14.88888931274414;6.0;9.0;32.0;1.0;3744.629256154277
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886229056/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;1;17.22222137451172;14.88888931274414;6.0;9.0;32.0;1.0;3744.6292561542773
tmp_1.tif;0;0;2;10.625;14.083333015441895;13.791666984558105;24.0;64.0;2.0;4109.821107706579
FileName;Frame;Channel;NumOfObjects;MeanSize;MeanSurface;MeanLength
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602349301/tmp_1.tif
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886229056/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;2;16.5;48.0;1.5
FileName;Frame;Channel;Id;X;Y;Z;Size;Perimeter;Length;Intensity
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602349301/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;1;17.22222137451172;14.88888931274414;6.0;9.0;32.0;1.0;3744.629256154277
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886229056/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;1;17.22222137451172;14.88888931274414;6.0;9.0;32.0;1.0;3744.6292561542773
tmp_1.tif;0;0;2;10.625;14.083333015441895;13.791666984558105;24.0;64.0;2.0;4109.821107706579
FileName;Frame;Channel;NumOfObjects;MeanSize;MeanSurface;MeanLength
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602353909/tmp_1.tif
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886230537/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;2;21.5;61.0;3.0
FileName;Frame;Channel;Id;X;Y;Z;Size;Perimeter;Length;Intensity
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602353909/tmp_1.tif
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886230537/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;1;19.19230842590332;14.615385055541992;3.423076868057251;26.0;70.0;3.0;1787.5943960874624
tmp_1.tif;0;0;2;11.176470756530762;15.823529243469238;14.0;17.0;52.0;3.0;5401.7056180885
tmp_1.tif;0;0;2;11.176470756530762;15.823529243469238;14.0;17.0;52.0;3.0;5401.705618088499
FileName;Frame;Channel;NumOfObjects;MeanSize;MeanSurface;MeanLength
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602353909/tmp_1.tif
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886230537/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;2;21.5;61.0;3.0
FileName;Frame;Channel;Id;X;Y;Z;Size;Perimeter;Length;Intensity
%background:/home/gonciarz/scratch/session1457602353909/tmp_1.tif
%background:/home/gonciarz/scratch/session1474886230537/tmp_1.tif
tmp_1.tif;0;0;1;19.19230842590332;14.615385055541992;3.423076868057251;26.0;70.0;3.0;1787.5943960874624
tmp_1.tif;0;0;2;11.176470756530762;15.823529243469238;14.0;17.0;52.0;3.0;5401.7056180885
tmp_1.tif;0;0;2;11.176470756530762;15.823529243469238;14.0;17.0;52.0;3.0;5401.705618088499
Markdown is supported
0% or
You are about to add 0 people to the discussion. Proceed with caution.
Finish editing this message first!
Please register or to comment